长途运输小龙虾时，可以采用以下方法来确保其存活率和新鲜度：

选择合适的运输时间

最好是夜间或阴天运输，因为夜间和阴天气温较低，有利于保持小龙虾箱内湿润。如果需要，可以在箱体里加冰，以保证更好的低温和湿度。

控制温度和湿度

运输龙虾时的水温应控制在1-7℃，这样可以使龙虾处于休眠状态，减少氧气的消耗，避免碰伤，有利于提高运输的成活率。相对湿度应保持在70%-100%，以防止龙虾脱水。

使用密封性能良好的运输工具

运输过程中不能通风，因为小龙虾通过腮来呼吸，风会把腮里面的水分带走，导致小龙虾脱水死亡。因此，一定要用有一定密封性能的车来运送，尽量不要用敞篷车。

带水运输

带水运输法可以满足量级最大，采用帆布篓、木桶、水缸、帆布袋和尼龙袋为装运容器，相对来说方便，且可获得较高的龙虾成活率。运输途中，每隔3-4小时用清洁水喷淋1次，以确保虾体具有一定的湿润性。

在运输水中加放水葫芦等辅助物

加放水葫芦有助于小龙虾抱着水草，减少下沉缺氧而死亡。运输途中，如发现小龙虾在水中不停乱窜，表明容器中的水质已变坏，应立即更换新水。

使用冷藏车

如果条件允许，可以使用冷藏车进行低温贮运，将虾逐步降温至合适的温度，然后保持在一定温度内，即可较长时间的贮运。

注意运输密度

装运时，密度要适量，避免虾被压死或闷死。例如，10升容积的木桶或帆布袋可盛水4-5升，放小龙虾6-8千克。

提前排空肠道

在运输前，预先排空小龙虾的肠道，可以促使其提前适应惊扰刺激和高密度运输环境，以保持运输过程中水不被污染，提高运输成活率。

通过以上方法，可以有效地提高小龙虾长途运输的成活率和新鲜度。