根据搜索结果，重庆市有以下土元养殖基地分布情况：

一、主要养殖区域及基地万州区

- 黄泥坪、琴浦、邓家坪等地：地势平坦、气候适宜，适合规模化养殖，主要种植蔬菜水果并养殖土元。

- 陈辉土元养殖场：位于黑马村4组94号，成立于2015年，注册资本15万人民币，主营土鳖虫养殖（注：企业信息显示已注销）。

九龙坡区

- 巴国城、羊皮坡、渝西养殖基地：依托山区优势，形成规模化养殖，同时养殖其他家禽家畜。

渝北区

- 天鑫农场：大型现代化养殖基地，以规模化土元养殖为主，采用先进管理模式。

江津区

- 多图土元养殖场：成立于2014年，注册资本10万人民币，位于西湖镇关胜村，主营土元养殖。

二、其他相关区域

南岸区、黔江区、巫山县：

气候、土壤条件适宜，存在一定规模养殖基地。

三、补充说明

部分基地如石船镇大堰村、六阳桥、半坡等地也有小型养殖场，但信息权威性较低，建议提前核实。

不同基地的养殖规模和管理水平差异较大，可根据需求选择合作对象。

以上信息综合自政府公开资料及企业注册信息，供参考。