苗木基地被强拆时，可通过以下法律途径维护自身权益：

一、确认强拆合法性审查强拆主体资格

确认实施强拆的部门是否为具有法定拆迁权限的县级以上政府或指定部门，非法定主体强拆行为无效。

检查程序合规性

强拆需经依法作出的征收决定、送达决定书等程序，且每个环节应留存法律文书。

二、收集关键证据

现场证据

拍照、录像强拆过程，留存强拆通知、决定书等书面文件。

权属证明

提供苗木基地所有权或使用权证明文件。

三、依法维权途径

申请行政复议

向作出强拆决定的上一级行政机关申请复议，要求撤销违法决定或确认违法。

提起行政诉讼

若复议不满意或未答复，可向人民法院提起诉讼，主张恢复原状或赔偿损失。

要求国家赔偿

依据《国有土地上房屋征收与补偿条例》，因违法强拆造成的直接损失（如苗木损失、搬迁费用）可要求赔偿。

四、其他救济措施

信息公开申请

向政府部门申请公开强拆依据、程序等信息，监督执法行为。

投诉与曝光

通过环保、国土等监督部门举报，或借助媒体曝光促使其纠正。

事后补救

若强拆后诉讼生效但已执行，可申请执行回转或申诉至高级法院。

五、注意事项

时效要求：

行政复议时效为60日，行政诉讼时效为6个月，需及时行动。

赔偿范围：包括直接损失（如苗木、设备损失）和间接损失（如经营中断损失），具体金额需结合评估报告确定。

通过以上步骤，可有效维护苗木基地的合法权益，避免因强拆行为遭受不当损失。